Protein–RNA interactions for Protein: P06800

Ptprc, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, mousemouse

Predictions only

Length 1,291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprcP06800 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprcP06800 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprcP06800 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprcP06800 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprcP06800 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprcP06800 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprcP06800 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprcP06800 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprcP06800 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprcP06800 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprcP06800 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprcP06800 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprcP06800 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprcP06800 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprcP06800 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprcP06800 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprcP06800 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprcP06800 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprcP06800 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprcP06800 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprcP06800 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprcP06800 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprcP06800 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprcP06800 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprcP06800 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprcP06800 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprcP06800 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprcP06800 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprcP06800 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprcP06800 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprcP06800 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprcP06800 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprcP06800 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprcP06800 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprcP06800 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprcP06800 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprcP06800 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprcP06800 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprcP06800 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprcP06800 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprcP06800 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprcP06800 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprcP06800 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprcP06800 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprcP06800 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprcP06800 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprcP06800 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprcP06800 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprcP06800 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprcP06800 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprcP06800 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprcP06800 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprcP06800 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprcP06800 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprcP06800 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprcP06800 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprcP06800 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprcP06800 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprcP06800 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprcP06800 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprcP06800 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprcP06800 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprcP06800 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprcP06800 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprcP06800 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprcP06800 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprcP06800 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprcP06800 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprcP06800 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprcP06800 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprcP06800 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprcP06800 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprcP06800 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprcP06800 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprcP06800 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprcP06800 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprcP06800 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprcP06800 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprcP06800 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprcP06800 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprcP06800 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprcP06800 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprcP06800 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprcP06800 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprcP06800 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprcP06800 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprcP06800 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprcP06800 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprcP06800 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprcP06800 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprcP06800 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprcP06800 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprcP06800 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprcP06800 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprcP06800 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprcP06800 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprcP06800 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprcP06800 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprcP06800 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprcP06800 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms