Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Suclg2-204ENSMUST00000204224 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ptpn20O55082 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ptpn20O55082 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ptpn20O55082 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ptpn20O55082 6430548M08Rik-203ENSMUST00000108950 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ptpn20O55082 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ptpn20O55082 Dcaf12l1-201ENSMUST00000060481 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ptpn20O55082 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ptpn20O55082 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ptpn20O55082 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ptpn20O55082 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ptpn20O55082 Pklr-201ENSMUST00000047111 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ptpn20O55082 Zfp672-202ENSMUST00000064786 2765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ptpn20O55082 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ptpn20O55082 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ptpn20O55082 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ptpn20O55082 Slc2a4rg-ps-201ENSMUST00000127559 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ptpn20O55082 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ptpn20O55082 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ptpn20O55082 Gm26809-201ENSMUST00000180863 2981 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ptpn20O55082 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ptpn20O55082 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ptpn20O55082 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ptpn20O55082 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ptpn20O55082 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ptpn20O55082 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ptpn20O55082 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ptpn20O55082 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ptpn20O55082 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ptpn20O55082 Gripap1-201ENSMUST00000065932 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ptpn20O55082 Acmsd-201ENSMUST00000038006 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ptpn20O55082 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ptpn20O55082 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ptpn20O55082 Ggcx-201ENSMUST00000065906 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ptpn20O55082 Slc35c1-201ENSMUST00000067631 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ptpn20O55082 Bpifb9a-201ENSMUST00000088924 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ptpn20O55082 Cd160-203ENSMUST00000165991 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ptpn20O55082 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ptpn20O55082 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ptpn20O55082 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ptpn20O55082 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ptpn20O55082 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ptpn20O55082 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ptpn20O55082 Fes-201ENSMUST00000080932 2762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ptpn20O55082 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ptpn20O55082 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ptpn20O55082 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ptpn20O55082 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ptpn20O55082 Ifi211-201ENSMUST00000009340 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ptpn20O55082 Arhgap45-202ENSMUST00000099501 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ptpn20O55082 Ccdc15-202ENSMUST00000213633 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptpn20O55082 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptpn20O55082 Fyn-205ENSMUST00000135242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptpn20O55082 Slc13a4-201ENSMUST00000031868 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptpn20O55082 Slc34a2-201ENSMUST00000094787 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptpn20O55082 Sfi1-202ENSMUST00000081318 3969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptpn20O55082 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptpn20O55082 Pear1-216ENSMUST00000174759 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptpn20O55082 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptpn20O55082 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptpn20O55082 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptpn20O55082 Sdhc-202ENSMUST00000111336 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptpn20O55082 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptpn20O55082 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptpn20O55082 Fam53c-202ENSMUST00000097622 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptpn20O55082 Unc13d-209ENSMUST00000174822 3337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptpn20O55082 Stat5a-201ENSMUST00000004145 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptpn20O55082 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptpn20O55082 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptpn20O55082 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptpn20O55082 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptpn20O55082 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptpn20O55082 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptpn20O55082 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptpn20O55082 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptpn20O55082 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptpn20O55082 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptpn20O55082 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptpn20O55082 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptpn20O55082 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptpn20O55082 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptpn20O55082 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptpn20O55082 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptpn20O55082 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptpn20O55082 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptpn20O55082 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptpn20O55082 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptpn20O55082 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptpn20O55082 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptpn20O55082 Zfp111-202ENSMUST00000073833 3079 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptpn20O55082 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptpn20O55082 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptpn20O55082 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptpn20O55082 Stau1-202ENSMUST00000109235 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptpn20O55082 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptpn20O55082 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptpn20O55082 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptpn20O55082 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptpn20O55082 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptpn20O55082 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms