Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms