Protein–RNA interactions for Protein: O35071

Kif1c, Kinesin-like protein KIF1C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif1cO35071 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 P2ry14-206ENSMUST00000197841 2476 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 Gm21039-201ENSMUST00000223359 2012 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 Ap1g1-206ENSMUST00000179104 1096 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Kif1cO35071 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms