Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Casq1O09165 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Casq1O09165 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Casq1O09165 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Casq1O09165 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Casq1O09165 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Casq1O09165 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Casq1O09165 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Casq1O09165 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Casq1O09165 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Casq1O09165 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Casq1O09165 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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