Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms