Protein–RNA interactions for Protein: J3QPZ4

Gm20877, MCG1032490, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20877J3QPZ4 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20877J3QPZ4 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms