Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 C730036E19Rik-201ENSMUST00000188305 1102 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Gm26848-201ENSMUST00000181052 2467 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Milr1-202ENSMUST00000106794 1514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Gm2035J3QP87 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Gm2035J3QP87 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Gm2035J3QP87 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 AC173482.3-201ENSMUST00000225492 1212 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 AC125539.1-201ENSMUST00000227423 622 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms