Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms