Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

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Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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