Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
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Gm28048F7BCN0 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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