Protein–RNA interactions for Protein: F6VRN1

Smgc, Submandibular gland protein C (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmgcF6VRN1 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms