Protein–RNA interactions for Protein: E9PYK3

Parp4, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp4E9PYK3 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Parp4E9PYK3 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Parp4E9PYK3 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Parp4E9PYK3 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Parp4E9PYK3 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Parp4E9PYK3 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Parp4E9PYK3 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Parp4E9PYK3 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Parp4E9PYK3 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Parp4E9PYK3 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Parp4E9PYK3 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Parp4E9PYK3 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Parp4E9PYK3 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Parp4E9PYK3 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Parp4E9PYK3 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Parp4E9PYK3 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Parp4E9PYK3 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Parp4E9PYK3 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Parp4E9PYK3 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Parp4E9PYK3 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Parp4E9PYK3 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Parp4E9PYK3 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Parp4E9PYK3 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Parp4E9PYK3 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Parp4E9PYK3 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Parp4E9PYK3 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Parp4E9PYK3 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Parp4E9PYK3 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Parp4E9PYK3 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Parp4E9PYK3 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Parp4E9PYK3 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Parp4E9PYK3 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Parp4E9PYK3 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Parp4E9PYK3 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Parp4E9PYK3 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Parp4E9PYK3 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Parp4E9PYK3 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Parp4E9PYK3 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Parp4E9PYK3 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Parp4E9PYK3 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Parp4E9PYK3 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Parp4E9PYK3 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Parp4E9PYK3 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Parp4E9PYK3 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Parp4E9PYK3 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Parp4E9PYK3 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Parp4E9PYK3 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Parp4E9PYK3 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Parp4E9PYK3 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Parp4E9PYK3 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Parp4E9PYK3 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Parp4E9PYK3 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Parp4E9PYK3 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Parp4E9PYK3 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Parp4E9PYK3 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Parp4E9PYK3 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Parp4E9PYK3 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Parp4E9PYK3 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Parp4E9PYK3 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Parp4E9PYK3 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Parp4E9PYK3 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Parp4E9PYK3 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Parp4E9PYK3 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Parp4E9PYK3 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Parp4E9PYK3 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Parp4E9PYK3 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Parp4E9PYK3 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Parp4E9PYK3 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Parp4E9PYK3 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Parp4E9PYK3 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Parp4E9PYK3 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Parp4E9PYK3 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Parp4E9PYK3 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Parp4E9PYK3 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Parp4E9PYK3 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Parp4E9PYK3 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Parp4E9PYK3 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Parp4E9PYK3 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Parp4E9PYK3 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Parp4E9PYK3 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Parp4E9PYK3 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Parp4E9PYK3 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Parp4E9PYK3 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Parp4E9PYK3 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Parp4E9PYK3 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Parp4E9PYK3 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Parp4E9PYK3 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Parp4E9PYK3 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Parp4E9PYK3 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Parp4E9PYK3 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Parp4E9PYK3 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Parp4E9PYK3 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Parp4E9PYK3 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Parp4E9PYK3 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Parp4E9PYK3 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Parp4E9PYK3 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Parp4E9PYK3 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Parp4E9PYK3 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Parp4E9PYK3 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Parp4E9PYK3 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms