Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms