Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F4

Ttll11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll11A4Q9F4 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ttll11A4Q9F4 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ttll11A4Q9F4 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ttll11A4Q9F4 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ttll11A4Q9F4 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ttll11A4Q9F4 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ttll11A4Q9F4 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ttll11A4Q9F4 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
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Ttll11A4Q9F4 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
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Ttll11A4Q9F4 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ttll11A4Q9F4 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ttll11A4Q9F4 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ttll11A4Q9F4 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ttll11A4Q9F4 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ttll11A4Q9F4 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Ttll11A4Q9F4 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ttll11A4Q9F4 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ttll11A4Q9F4 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ttll11A4Q9F4 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ttll11A4Q9F4 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ttll11A4Q9F4 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ttll11A4Q9F4 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ttll11A4Q9F4 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ttll11A4Q9F4 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ttll11A4Q9F4 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ttll11A4Q9F4 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ttll11A4Q9F4 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ttll11A4Q9F4 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Ttll11A4Q9F4 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ttll11A4Q9F4 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ttll11A4Q9F4 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ttll11A4Q9F4 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Ttll11A4Q9F4 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ttll11A4Q9F4 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Ttll11A4Q9F4 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Ttll11A4Q9F4 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ttll11A4Q9F4 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ttll11A4Q9F4 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ttll11A4Q9F4 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Ttll11A4Q9F4 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ttll11A4Q9F4 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Ttll11A4Q9F4 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ttll11A4Q9F4 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ttll11A4Q9F4 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Ttll11A4Q9F4 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Ttll11A4Q9F4 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ttll11A4Q9F4 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ttll11A4Q9F4 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ttll11A4Q9F4 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ttll11A4Q9F4 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Ttll11A4Q9F4 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ttll11A4Q9F4 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ttll11A4Q9F4 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ttll11A4Q9F4 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ttll11A4Q9F4 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ttll11A4Q9F4 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ttll11A4Q9F4 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ttll11A4Q9F4 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ttll11A4Q9F4 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ttll11A4Q9F4 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ttll11A4Q9F4 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ttll11A4Q9F4 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ttll11A4Q9F4 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ttll11A4Q9F4 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ttll11A4Q9F4 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ttll11A4Q9F4 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ttll11A4Q9F4 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ttll11A4Q9F4 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ttll11A4Q9F4 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ttll11A4Q9F4 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ttll11A4Q9F4 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ttll11A4Q9F4 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ttll11A4Q9F4 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ttll11A4Q9F4 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ttll11A4Q9F4 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.6 ms