Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC6.84□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
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