Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 796.9 ms