Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.9 ms