Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL95

Prg3, Proteoglycan 3, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg3Q9JL95 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 Tnnt3-214ENSMUST00000105953 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 Pex5l-203ENSMUST00000108221 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 Gm12000-201ENSMUST00000132007 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 Gm24943-201ENSMUST00000158329 433 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 Cdhr4-208ENSMUST00000176373 492 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 Gm8234-201ENSMUST00000198523 1107 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 AC137871.1-201ENSMUST00000228278 475 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 Tnfrsf18-201ENSMUST00000040274 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 AC137950.2-202ENSMUST00000227150 1635 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 Gm23769-201ENSMUST00000104441 121 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 Gm5395-201ENSMUST00000121650 915 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 Tex29-204ENSMUST00000166638 561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 Rpl13-ps4-201ENSMUST00000194776 628 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 Olfr435-201ENSMUST00000058118 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 1700112K13Rik-201ENSMUST00000141892 701 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 Gm12676-201ENSMUST00000149078 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 Lockd-205ENSMUST00000185152 496 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 1700085C21Rik-201ENSMUST00000187123 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prg3Q9JL95 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms