Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS5

Habp4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Habp4Q9JKS5 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Gm23255-201ENSMUST00000102244 110 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Tprg-201ENSMUST00000056087 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Gm9166-201ENSMUST00000120293 561 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Gm23675-201ENSMUST00000157311 125 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 4933430L12Rik-201ENSMUST00000206788 1194 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Ensa-202ENSMUST00000058230 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Cdkn3-201ENSMUST00000067426 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms