Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Ap5s1-203ENSMUST00000110208 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Igll1-201ENSMUST00000100136 870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Gm7861-201ENSMUST00000110749 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Gm7849-201ENSMUST00000110752 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 6430531B16Rik-202ENSMUST00000121412 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Gm13031-201ENSMUST00000140501 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Gm5526-201ENSMUST00000153604 423 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Gm7833-201ENSMUST00000183288 990 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 AC124503.1-201ENSMUST00000218524 526 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Gm5040-201ENSMUST00000218609 800 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 AC124356.1-201ENSMUST00000221469 698 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Speer4f1-201ENSMUST00000076099 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Hsf2-204ENSMUST00000220042 2430 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Csde1-207ENSMUST00000197827 2671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Gm8464-202ENSMUST00000146697 1142 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Gm4750-201ENSMUST00000151942 1142 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 2810433D01Rik-202ENSMUST00000154798 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Erg-209ENSMUST00000177450 1280 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Gm18555-201ENSMUST00000197935 584 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Gm5738-201ENSMUST00000206016 779 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Mptx1-201ENSMUST00000027816 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Lcn3-201ENSMUST00000028304 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Acnat1-201ENSMUST00000095086 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms