Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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