Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
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Usp29Q9ES63 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
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