Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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