Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.4 ms