Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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