Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Trappc6bQ9D289 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Trappc6bQ9D289 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
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