Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Ddx28Q9CWT6 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Ddx28Q9CWT6 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Ddx28Q9CWT6 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Ddx28Q9CWT6 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Ddx28Q9CWT6 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Ddx28Q9CWT6 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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