Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF4

Uncharacterized protein C6orf203 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQF4 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9CQF4 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9CQF4 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9CQF4 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9CQF4 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9CQF4 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9CQF4 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9CQF4 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9CQF4 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9CQF4 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9CQF4 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9CQF4 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9CQF4 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9CQF4 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9CQF4 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9CQF4 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9CQF4 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9CQF4 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9CQF4 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9CQF4 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9CQF4 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9CQF4 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9CQF4 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9CQF4 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9CQF4 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9CQF4 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9CQF4 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9CQF4 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9CQF4 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9CQF4 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9CQF4 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9CQF4 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9CQF4 Gm28635-201ENSMUST00000189772 4734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9CQF4 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9CQF4 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9CQF4 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9CQF4 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9CQF4 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9CQF4 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9CQF4 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9CQF4 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9CQF4 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9CQF4 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9CQF4 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9CQF4 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9CQF4 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9CQF4 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9CQF4 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9CQF4 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9CQF4 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9CQF4 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9CQF4 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9CQF4 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9CQF4 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9CQF4 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9CQF4 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9CQF4 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9CQF4 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9CQF4 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9CQF4 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9CQF4 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9CQF4 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9CQF4 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9CQF4 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9CQF4 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9CQF4 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9CQF4 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9CQF4 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9CQF4 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9CQF4 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9CQF4 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9CQF4 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9CQF4 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9CQF4 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9CQF4 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9CQF4 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9CQF4 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9CQF4 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9CQF4 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9CQF4 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9CQF4 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9CQF4 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9CQF4 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9CQF4 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9CQF4 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9CQF4 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9CQF4 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9CQF4 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9CQF4 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9CQF4 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9CQF4 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9CQF4 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9CQF4 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9CQF4 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9CQF4 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9CQF4 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9CQF4 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9CQF4 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9CQF4 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9CQF4 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms