Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Chmp3Q9CQ10 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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Chmp3Q9CQ10 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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