Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
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