Protein–RNA interactions for Protein: Q99P87

Retn, Resistin, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RetnQ99P87 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Lig4-201ENSMUST00000095476 5028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Nol8-209ENSMUST00000223467 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC8.49□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC8.49□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC8.49□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC8.49□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Aebp2-201ENSMUST00000032359 5932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Spata13-201ENSMUST00000022566 7517 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Ccdc93-201ENSMUST00000036025 7274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Plxnb3-201ENSMUST00000002079 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Celf1-208ENSMUST00000111455 7579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Ldb3-205ENSMUST00000090040 4981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Ctnnd1-205ENSMUST00000111670 5047 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC8.48□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Olfr130-202ENSMUST00000215726 5810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Ubr1-201ENSMUST00000028728 7768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms