Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms