Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Hdac9Q99N13 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Hdac9Q99N13 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Hdac9Q99N13 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
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Hdac9Q99N13 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Hdac9Q99N13 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Hdac9Q99N13 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms