Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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