Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms