Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm1Q8K377 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms