Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHZ9

Mterf1a, Transcription termination factor 1a, mitochondrial, mousemouse

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1aQ8CHZ9 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Mterf1aQ8CHZ9 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms