Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Rab11fip3Q8CHD8 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Rab11fip3Q8CHD8 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Rab11fip3Q8CHD8 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Rab11fip3Q8CHD8 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms