Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
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Ercc8Q8CFD5 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
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Ercc8Q8CFD5 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
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Ercc8Q8CFD5 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
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Ercc8Q8CFD5 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
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Ercc8Q8CFD5 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
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Ercc8Q8CFD5 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
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