Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC88

Vwa8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa8Q8CC88 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Vwa8Q8CC88 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.8 ms