Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5V8

Ccdc187, Coiled-coil domain-containing protein 187, mousemouse

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Length 958 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc187Q8C5V8 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ccdc187Q8C5V8 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ccdc187Q8C5V8 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ccdc187Q8C5V8 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ccdc187Q8C5V8 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ccdc187Q8C5V8 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Ccdc187Q8C5V8 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Ccdc187Q8C5V8 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Ccdc187Q8C5V8 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Ccdc187Q8C5V8 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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