Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.4 ms