Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Usp38Q8BW70 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Usp38Q8BW70 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Usp38Q8BW70 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Usp38Q8BW70 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Usp38Q8BW70 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Usp38Q8BW70 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Usp38Q8BW70 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Usp38Q8BW70 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Usp38Q8BW70 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Usp38Q8BW70 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms