Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc30Q8BVF4 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc30Q8BVF4 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc30Q8BVF4 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc30Q8BVF4 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms