Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms