Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms