Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNU6

Znf250, Zinc finger protein 250, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf250Q7TNU6 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Znf250Q7TNU6 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf250Q7TNU6 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms