Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Slc16a5-202ENSMUST00000106532 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Gm26541-201ENSMUST00000181866 3973 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Sp100-201ENSMUST00000054279 1978 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Ppef2-202ENSMUST00000201130 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Cd300lg-202ENSMUST00000107163 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Kir3dl2-201ENSMUST00000072125 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Nlgn3-201ENSMUST00000065858 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Arhgap17-202ENSMUST00000106442 3336 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Ldb3-205ENSMUST00000090040 4981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Cd160-203ENSMUST00000165991 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Nek5-201ENSMUST00000169834 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Actn2-201ENSMUST00000064204 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Gpatch2-202ENSMUST00000065573 4547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Zfhx3-201ENSMUST00000043896 16433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Pigq-218ENSMUST00000208043 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Fgfr1-213ENSMUST00000167764 2915 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Tmco4-201ENSMUST00000043042 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Colq-205ENSMUST00000150054 2867 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Gm26772-201ENSMUST00000180466 3429 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Mre11a-201ENSMUST00000034405 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Gm29125-201ENSMUST00000187121 3220 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Zdbf2-201ENSMUST00000029025 12112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Lrrc61-202ENSMUST00000114545 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Nfrkb-201ENSMUST00000086167 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Dsg1a-201ENSMUST00000077146 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Myadm-201ENSMUST00000096744 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Dclk1-203ENSMUST00000167204 6025 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Git2-203ENSMUST00000112183 4886 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Atg16l2-201ENSMUST00000120267 6459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Fyn-205ENSMUST00000135242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Msln-201ENSMUST00000075884 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Fmo3-201ENSMUST00000028010 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Gm9220-201ENSMUST00000190721 2544 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Ywhag-201ENSMUST00000055808 3520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Tacc2-208ENSMUST00000207549 3492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Cct3-201ENSMUST00000001452 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Suclg2-204ENSMUST00000204224 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 1700030K09Rik-201ENSMUST00000064853 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Adgb-201ENSMUST00000045328 1893 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Bcl2l11-202ENSMUST00000089634 2301 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Slc14a2-201ENSMUST00000025434 2793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Ldlr-201ENSMUST00000034713 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Pde2a-204ENSMUST00000209537 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Serpina3g-201ENSMUST00000043315 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Itgal-203ENSMUST00000118405 3909 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Gm26822-201ENSMUST00000181732 3374 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Amph-201ENSMUST00000003345 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Cfap43-202ENSMUST00000095998 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Flna-202ENSMUST00000101454 8345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed3Q78IS1 Ints3-201ENSMUST00000029542 4337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms