Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDM2

Srsf1, Serine/arginine-rich splicing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf1Q6PDM2 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 2310009A05Rik-201ENSMUST00000184126 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Mir7088-201ENSMUST00000184227 86 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Gm5267-201ENSMUST00000191574 1045 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 AC162938.2-202ENSMUST00000215497 722 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 AC169511.1-201ENSMUST00000227639 995 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Crygf-201ENSMUST00000027082 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Mt4-201ENSMUST00000034207 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Tmsb15b2-201ENSMUST00000069803 450 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Gm7701-201ENSMUST00000163185 1479 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Mir705-201ENSMUST00000102058 82 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Gm23745-201ENSMUST00000104230 125 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Gm12418-201ENSMUST00000118116 942 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Gm15746-201ENSMUST00000120684 1027 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 AA623943-201ENSMUST00000121794 354 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Gm16048-201ENSMUST00000134250 663 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 4930509H03Rik-201ENSMUST00000196088 1215 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 AC174797.2-201ENSMUST00000225835 165 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Hsd3b3-204ENSMUST00000107019 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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